Sõnastik

2-Abz - 2-Aminobensoüül, ühineb tavaliselt 2,4-dinitrofenüüliga (Dnp) või 3-nitro-türosiiniga (NitroTyr), moodustades fluorofoor/kustutaja paarid. ergastus 320 nm juures, emissioon 420 nm juures.

3-Abz (m-aminobensoehapet) võib vaadelda kui -aminohapet. Kui m-aminobensoehape lülitatakse peptiidahelatesse, tekib jäik pööre.

4-Abz-i (p-aminobensoehape, PABA), mis on looduslikult esinev bensoehappe derivaat, saab kasutada ka jäiga lineaarse vahekihina.

Abu, L- -Aminobutürüül ((S)-2-Aminobutanoüül), -aminovõihape, on aminohappe derivaat. Struktuurilise sarnasuse tõttu looduslike aminohapetega kasutatakse seda sageli peptiidide ja peptiidimimeetikumide kujundamisel ja sünteesil.

Ac tähistab atsetüülrühma. N-terminaalne atsetüülimine on peptiidide tavaline stabiliseeriv modifikatsioon looduses.

Acm, atsetamidometüül, saab eemaldada Hg(II) või Ag(I) abil. See on üks tsüsteiini tioolikaitserühmi, mida kasutatakse mitme disulfiidsidemega peptiidide sünteesimisel.

ACTH (adrenokortikotroopne hormoon) on hüpofüüsi eesmise osa eritatav hormoon, mis stimuleerib neerupealiste koort tootma kortikosteroide.

Aad (L- -aminoadipiinhape) on mitteproteinogeenne aminohape. Selle struktuur sarnaneb glutamiinhappega (Glu), selle kõrvalahelas on täiendav metüleenrühm.

(2-Aminoetoksü)äädikhapet, tuntud ka kui glütsiini etüülester või glütsiinetüülamiid, saab kasutada peptiidi modifitseerimise sünteesis speisserina või linkerina.

1-(1'-adamantüül)-1-metüületoksükarbonüül, peptiidide sünteesis väga happelabiilne aminokaitserühm, saab deprotekteerida 3% TFA/CH2Cl2-ga

AFC (7-amino-4-trifluorometüülkumariin) on fluorestseeruv ühend, mille vabanenud kumariini ergastatakse lainepikkusel 395-400 nm, emissioon 495-505 nm juures.

Suurema molekulmassiga liigid tekivad väiksemate liikide mittekovalentse adhesiooni tõttu. Eelkõige valkude puhul on agregatsioon denaturatsiooni vorm, mis võib toimuda sekundaarse struktuuriga mittepolaarsetel pindadel, nagu need, mis tavaliselt moodustavad molekulisiseseid interaktsioone ja on mattunud valgu -heeliksidesse ja -lehtedesse. Molekulid interakteeruvad üksteisega, moodustades mõnikord lahustumatuid polümolekulaarseid vorme. Agregatsioon vastandub oligomerisatsioonile, õigesti volditud looduslike valkude normaalsele interaktsioonile, et moodustada kõrgemat järku polümeere.

AHX, aminoheksanoüül, 6-aminoheksaanhape, lühendatult ka Aca või LC, kasutatakse tavaliselt lühikese mittepolaarse vahetükina biotiini, fluorofooride ja peptiidijärjestuste vahel.

2-Aminoisovõihape on haruldane mittevalguline aminohape, mis on pürimidiini metabolismi lõpp-produkt, mis eritub uriiniga ja sisaldub mõnes seente päritolu antibiootikumis. Kasutatakse ka looduslike aminohapete asendamiseks peptiidide sünteesiks.

Alkoholid on need orgaanilised ühendid, mida iseloomustab ühe, kahe või enama hüdroksüülrühma (-OH) olemasolu, mis on seotud süsinikuaatomiga alküülrühmas või süsivesinikahelas. Peptiidalkoholid on kliiniliselt olulised ühendid, mida struktuuri ja aktiivsuse seose (SAR) uuringutes ravimite avastamiseks ei ole piisavalt uuritud. Näiteks DAMGO on opioidiretseptori agonist, mida C-otsas on modifitseeritud alkoholiga ja mille järjestus on Tyr-{d-Ala}-Gly-{Me-Phe}-Gly-ol. Sellel on kõrge selektiivsus ja afiinsus μ-opioidiretseptori suhtes.

Aldehüüd on orgaaniline ühend, milles karbonüülrühm on seotud süsinikuahela lõpus oleva süsinikuaatomiga. Peptiidaldehüüdid on olulised vahendid biokeemias ja keemilises bioloogias proteaaside inhibeerimiseks ja keemiliseks blokeerimiseks.

Aloc – allüüloksükarbonüül, amino kaitserühm (lühendatult ka Alloc). Kaitset saab eemaldada Pd(PPh3)4-ga.

Alzheimeri tõbi, mida iseloomustavad amüloidnaastud ja tau sasipundar, tuleneb sünaptilisest düsfunktsioonist ja kliirensraja probleemidest, põhjustades kognitiivseid häireid.

7-Amino-4-metüülkumariin (AMC) on tavaline fluorestseeruv sond peptiidide märgistamiseks proteaasiuuringutes. Selle konjugeerimine peptiidiga kustutab fluorestsentssignaali ja proteaasi lõhustamisel vabanenud AMC võib kvantifitseerida ensüümi aktiivsust ergastuse/emissiooni maksimumiga 345/445 nm. Näiteks eelistatud substraadi fluorestseeruv peptiid puhastatud proteasoomi trüpsiinitaolise aktiivsuse määramiseks järjestusega: Ac-Arg-Leu-Arg-AMC.

Kodade natriureetiline peptiid (ANP), hormoon, mida toodab ja vabastab südame kodad vastusena suurenenud veremahule ja rõhule. See reguleerib vedeliku tasakaalu ja vererõhku, soodustades vasodilatatsiooni, suurendades uriini tootmist (diureesi) ja vähendades naatriumi tagasiimendumist neerudes. Need toimingud aitavad neutraliseerida kõrge vererõhu ja vedeliku ülekoormuse mõjusid kehas.

Antigeensed peptiidid on lühikesed aminohappejärjestused, mis on saadud valkudest või muudest biomolekulidest, mis käivitavad organismi immuunvastuse. Immuunsüsteem tunnistab need peptiidid organismile võõraks või võõraks, mis viib immuunrakkude, nagu T- ja B-rakkude, aktiveerimiseni. Antigeensed peptiidid mängivad olulist rolli immuunvastustes, sealhulgas adaptiivses antikehade tootmises ja immuunmälu arengus. Neid uuritakse laialdaselt immunoloogias ja vaktsiinide väljatöötamises, kuna neil on potentsiaal vallandada spetsiifilisi immuunvastuseid patogeenide või ebanormaalsete rakkude vastu.

2, 4 ja 8 haruga asümmeetriliste peptiidide sünteesi saab saavutada lüsiini, arginiini või glutamiinhappe strateegilise sisestamisega peptiidijärjestusse.

Asümmeetriline dimetüülarginiin (ADMA, Arg(Me)2) on looduslikult esinev keemiline ühend ja endogeenne lämmastikoksiidi süntaasi (NOS) inhibiitor. Fmoc-Arg(Me)2-OH (asümmeetriline) saab otseselt kasutada asümmeetrilist dimetüülarginiini sisaldavate peptiidide sünteesiks.

5-Aminovaleriinhapet saab kasutada peptiidide modifitseerimise sünteesis speisserina või linkerina.

Bensüüloksümetüül (Bom) on happelabiilne imidasooli kaitserühm, mida kasutatakse Boc-SPPS protsessis histidiini sisaldavate peptiidide jaoks. Bensüüloksümetüül toodab pärast happega töötlemist väga reaktiivset formaldehüüdi. Seetõttu lõhustub Bom kõige paremini Cys, metoksüamiini või muude aldehüüdidega reageerivate ühendite juuresolekul.

-aminohapete aminorühm on seotud -süsinikuga, mis on karboksüülrühmast teine ​​süsinikuaatom. Aminohappe üldise struktuurivalemi võib esitada järgmiselt: R-CH(NH2)-COOH

B-tüüpi natriureetiline peptiid (BNP), hormoon, mida toodavad peamiselt südame vatsakesed vastusena südamelihase rakkude liigsele venitamisele. See mängib üliolulist rolli vererõhu ja vedelikutasakaalu reguleerimisel, eelkõige soodustades vasodilatatsiooni ja suurendades naatriumi eritumist neerude kaudu.

t-butüüloksükarbonüül (Boc) on peptiidide sünteesil väga happe-labilea-amino kaitserühm, saab lõhustada TFA/metüleenkloriidiga (1:1), HCl-ga etüülatsetaadis või dioksaanis, 98% sipelghape.

2-(4-Bifenülüül)isopropüüloksükarbonüül (Bpoc) on peptiidide sünteesis väga happe-labiilamino-kaitserühm, mida saab lõhustada 1% TFA/metüleenkloriidiga.

2, 4 ja 8 haruga peptiide saab saavutada lüsiini, arginiini või glutamiinhappe strateegilise sisestamisega peptiidijärjestusse.

t-butüüldimetüülsilüül (TBS või TBDMS) on hüdroksüüli kaitserühm, mis ühildub Fmoc-SPPS-iga. See on happelabiilne ja seda saab selektiivselt lõhustada fluoriidioonidega.

Bensoüül on atsüülrühm, mida sageli sisestatakse peptiidide N-otsa. See on vähem polaarne kui atsetüül (Ac) ja võib olla püsiv modifikatsioon.

Bensüül (Bzl) on alküüljääk ja külgahela kaitserühm, mida kasutatakse peptiidide sünteesis alkoholide (Ser, Thr, Hyp) blokeerimiseks. seda saab lõhustada tugevate hapetega või katalüütilise hüdrogenolüüsiga (nt vesinik/Pd).

Koletsüstokiniin (CCK) on peptiidhormoon, mida toodab soolestiku ülaosa limaskest ja mida leidub kesknärvisüsteemis. See stimuleerib sapipõie kokkutõmbumist, pankrease ensüümide vabanemist ja mõjutab erinevaid seedetrakti protsesse.

Kaltsitoniini geeniga seotud peptiid (CGRP) on 37-aminohappepeptiid, mis on seotud kaltsitoniini, amüliini ja adrenomedulliiniga. See eksisteerib kahel kujul, -CGRP (CGRP I) ja -CGRP (CGRP II), millel on sarnane bioloogiline aktiivsus. CGRP leidub peamiselt sensoorsetes ja tsentraalsetes neuronites, mõjutades südame-veresoonkonna funktsiooni, kaltsiumi metabolismi ja loote platsenta veresoonte toonust. Selle retseptorid on seotud G-valguga ja aktiveerivad adenülaattsüklaasi, interakteerudes retseptori aktiivsust modifitseerivate valkudega (RAMP) ligandi spetsiifilisuse ja rakulise kaubitsemise tagamiseks.

L-tsükloheksüülalaniin (Cha) on fenüülalaniini mittepolaarne aminohappe analoog, kus aromaatne tsükkel on asendatud tsükloheksaani tsükliga. See asendus võimaldab uurida aromaatsete aminohapete rolli interaktsioonides, näiteks π-π interaktsioonides, asendades katsetes fenüülalaniini jäägid Cha-ga.

L- -Tsükloheksüülglütsiin (Chg) on ​​mittepolaarne aminohape, mis on steeriliselt takistatud. See toimib olulise farmatseutilise vaheühendina ja seda leidub ka looduslikes toodetes.

Kolesterooli toodavad looduslikult maks ja teised keharakud, kuid see võib pärineda ka toidust, mida me sööme, eriti loomsetest saadustest, nagu liha, linnuliha ja täisrasvased piimatooted. Farmakokineetika parandamiseks võib kolesterooli siduda peptiididega.

cis-hüdroksüproliin, loodusliku trans-hüdroksüproliini stereoisomeer.

Tsitrulliin esineb valkudes arginiinijääkide translatsioonijärgse ensümaatilise modifikatsiooni tulemusena.

CMK on RSK2 kinaasi inhibiitor, millel on sarnane tugevus, kuid väiksem keemiline stabiilsus kui FMK.

C-tüüpi natriureetiline peptiid (CNP) on veresoonte endoteelirakkude peptiid, mis on tuntud oma vasodilateeriva toime poolest. Sellel on struktuursed ja füsioloogilised sarnasused kodade ja aju natriureetiliste peptiididega (ANP ja BNP).

L- -Tsüklopentüülglütsüül (Cpg) on ​​mittepolaarne aminohape, mis on steeriliselt takistatud.

Peptiidjärjestuses on see ainulaadne jääk, mis on ühendatud lineaarse järjestusega selle aminorühma kaudu, jättes sellesse vaba karboksürühma. Selle jäägi karboksüülrühma võib muuta, näiteks amideerida või, näiteks püroglutamaat, sisemist laktameerimist.

Tsüaniin 3 on punaselt fluorestseeruv tsüaniinvärv, mida tavaliselt ergastab umbes 558 nm valgusallikas ja mis kiirgab valgust lainepikkusel umbes 572 nm.

Cyanine 5 on tsüaniinvärvi fluorofoor, mis kiirgab infrapuna-lähedast fluorestsentsi, mida tavaliselt ergastab valgusallikas lainepikkusel umbes 646 nm ja kiirgab valgust lainepikkusel umbes 664 nm.

L-, -diaminovõihape on ,ω-diaminohape, ornitiini (Orn) ja lüsiini (Lys) lühem analoog. Sobiva kaitse korral saab ,ω-diaminohappeid nende Nω positsioonis selektiivselt modifitseerida või lisada, et luua hargnenud peptiide või dendrimeere.

3-(Dimetüülaminoaso)benseen-4-karboksüülhape on aminorühmadega seotud kromofoor, mida kasutatakse biokeemias ja molekulaarbioloogias fluorestsentsresonantsenergia ülekande (FRET) kustutajana, nt EDANS-iga. DABCYL-i ergastus lainepikkusel 454 nm.

Dabsüül, 4-dimetüülaminobenseensulfonüülkloriid, aminorühmadega seotud kromofoor, mida kasutatakse kustutajana kombinatsioonis, nt EDANS-iga. Dabsyl ergastus 436 nm juures.

4-Dimetüülamino-1-naftaleensulfonüül, aminorühmadega seotud fluorofoor, ergastus 342 nm juures, emissioon 562 nm juures.

L-, -diaminopropioonhape (Dap või Dpr) on ,ω-diaminohape, mis on diaminovõihappe (Dab), ornitiini (Orn) ja lüsiini (Lys) lühem analoog. ω-diaminohapete modifitseeritud derivaate saab nende Nω-asendis selektiivselt muuta või lisada, et luua hargnenud peptiide või dendrimeere.

1-(4,4-Dimetüül-2,6-dioksotsükloheks-1-ülideen)etüül (Dde) on aminorühma kaitserühm, mida kasutatakse peptiidide sünteesis. Seda saab selektiivselt lõhustada, kasutades 2% hüdrasiinhüdraati dimetüülformamiidis (DMF). Nω-Dde võimaldab Dde spetsiifilist eemaldamist aminohapetest nagu Dap, Dab, Orn või Lys pärast Fmoc tahkefaasilise peptiidi sünteesi (SPPS), hõlbustades Nω-aminorühma vaigul modifitseerimist.

Disulfiidsidemed on kovalentsed sidemed, mis moodustuvad valkude tsüsteiinijääkide kahe sulfhüdrüülrühma (-SH) vahel.

2,4-dimetoksübensüül on happe suhtes labiilne formamiidi kaitserühm, mida kasutatakse peptiidide sünteesis karkassi pöörduvaks muutmiseks. Need lisatakse tahkefaasilise peptiidi sünteesi (SPPS) käigus aminohappe või dipeptiidina Fmoc-Dmb (Fmoc-Xaa-DmbYaa-OH), kus Fmoc takistab peptiidide agregatsiooni ja soodustab seega tõhusat pikenemist. Dmb soodustab ka tsükliseerimisreaktsioone ja takistab asparagimiidi moodustumist. Erinevalt Hmb derivaatidest ei moodusta Dmb aktiveerimise ajal bensoksasepiine.

2,4-Dinitrofenüül on aminorühmadega konjugeeritud kromofoor, mida kasutatakse tavaliselt kustutajana fluorestsentsresonantsenergia ülekande (FRET) substraatides.

4,4'-dimetoksüdüül, tuntud ka kui bis-(4-metoksüfenüül)metüül, on happelabiilne karboksamiidi kaitserühm, mis ühildub Fmoc tahkefaasilise peptiidi sünteesiga (SPPS).

DOPA, 3,4-dihüdroksüfenüülalaniin, on mitmete oluliste neurotransmitterite, sealhulgas dopamiini, norepinefriini ja epinefriini eelkäija.

(4,7,10-trikarboksümetüül-1,4,7,10-tetraasatsüklododetsüül)äädikhape, lühendatult DOTA, on tsükliline kelaat, mis on tavaliselt kinnitunud peptiidide N-otsa. DOTA hõlbustab peptiidide märgistamist radionukliididega nagu 68Ga või 90Y mitmesuguste biomeditsiiniliste rakenduste jaoks, sealhulgas pildistamine ja sihtravi.

Difenüülmetüül (ditüül), happelabiilne N-, O- ja S-kaitserühm.

Dietüleentriamiinpentaäädikhape (DTPA) on kasulik kelaativ aine radionukliididele, nagu (68)Ga, (99m)Tc ja (111)In, mida saab kasutada tuumameditsiinilise pildistamise jaoks.

5-[(2-Aminoetüül)amino]naftaleen-1-sulfoonhape (EDANS) on fluorofoor, mis on tavaliselt seotud diaminohapete, nagu lüsiin, Nω-ga. Seda kasutatakse sageli FRET-substraatides, tavaliselt paaris kustutajatega nagu DABCYL. EDANSi ergastuse lainepikkus on 340 nm ja kiirgab 490 nm.

Endoteeli monotsüüte aktiveeriv polüpeptiid.

Etüüli, alküülrühma ja metüüli (Me) homoloogi, kasutatakse peptiidides püsivateks N- ja S-etüülimise modifikatsioonideks.

Epitoopide kaardistamine (antigeeni epitoobi kaardistamine) on meetod, mida kasutatakse spetsiifiliste piirkondade (st antigeeni epitoopide) määramiseks antigeenil, mida saavad ära tunda antikehad või immuunsüsteem. Antigeeni epitoobid võib jagada lineaarseteks epitoopideks ja konformatsioonilisteks epitoopideks. Antigeeni epitoobi kaardistamise abil saame sügavalt mõista seost antigeeni struktuuri ja funktsiooni vahel, millel on suur tähtsus vaktsiini väljatöötamisel, haiguste diagnoosimisel, immunoteraapias ja muudes aspektides.
Mõned sagedamini kasutatavad antigeeni epitoobi kaardistamise meetodid on järgmised:
Röntgenkristallograafia: see võib otseselt analüüsida antigeeni kolmemõõtmelist struktuuri, määrates seeläbi epitoobi asukoha.
Tuumamagnetresonants: seda saab kasutada ka antigeeni struktuuri analüüsimiseks epitoobi määramiseks.
Peptiidide skaneerimise tehnika: kattuvate sünteetiliste peptiidi segmentide seeria kasutamine, et tuvastada antikehaga seonduv epitoop.
Näiteks vaktsiinide uurimis- ja arendustegevuses aitab antigeeni peamiste epitoopide selgitamine välja töötada tõhusamaid vaktsiine ja kutsuda esile sihipärasema immuunvastuse; haiguste diagnoosimisel saab spetsiifiliste haigustega seotud antigeeniepitoopide määramisel välja töötada täpsemaid diagnostilisi reaktiive.

5-FAM (5-karboksüfluorestseiin) on tavaliselt biomolekulide märgistamiseks kasutatav fluorofoor, mille ergastuslainepikkus on 490 nm ja emissioon lainepikkusel 520 nm.

Fluorestseiin-6-karbonüül on aminorühmadega seotud fluorofoor, mille ergastuslainepikkus on 490 nm ja emissioon lainepikkusel 520 nm.

Fluorestseiini isotiotsüanaat (FITC) on fluorofoor, mis reageerib aminorühmadega. Peptiidi märgistamisel selle N-otsas FITC-ga sisestatakse tavaliselt speisser nagu -alaniin või Ahx. FITC ergastuse lainepikkus on 490 nm ja emissioon 520 nm.

9-Fluorenüülmetüül on aluse suhtes labiilne kaitserühm, mida kasutatakse O- ja S-kaitseks.

FMK, fluorometüülketoon, on RSK2 kinaasi pöördumatu inhibiitor.

9-Fluorenüülmetoksükarbonüül (Fmoc), FMOC tahkefaasilise sünteesi aminokaitserühm, saab eemaldada 20% piperidiini/DMF-iga.

Formüül on Boc-SPPS-is kasutatav indooli kaitserühm. Trp(For) lõhustatakse HF poolt merkaptaani või aluste nagu piperidiini juuresolekul.

Fluorestsentsresonantsenergia ülekanne (FRET) on mittekiirgusliku energia ülekandmine ergastatud fluorofoorilt (doonorilt) sobivale aktseptorile (kustutajale). Ülekanne sõltub kaugusest, dipooli orientatsioonist ning doonori ja aktseptori spektraalsest kattumisest. FRET-i substraatides on fluorofoor ja kustutaja ühendatud peptiidahela kaudu. Ensümaatiline lõhustamine suurendab fluorestsentsi, eraldades doonori ja aktseptori.

Fluorestsents on valgust, mida kiirgab aine, mis neelab valgust või muud elektromagnetkiirgust. See juhtub siis, kui molekulid, mida nimetatakse fluorofoorideks, neelavad teatud lainepikkusega footoneid, erutuvad ja kiirgavad seejärel footoneid ning naasevad põhiolekusse. Kiirgataval valgusel on tavaliselt pikem lainepikkus ja väiksem energia kui neeldunud valgusel, mille tulemuseks on iseloomulik fluorestsentsspekter. Seda nähtust kasutatakse laialdaselt mitmesugustel teaduslikel ja meditsiinilistel eesmärkidel, sealhulgas mikroskoopias, voolutsütomeetrias ja fluorestsentsspektroskoopias.

Mao inhibeeriv polüpeptiid (GIP), tuntud ka kui glükoosist sõltuv insulinotroopne peptiid, kuulub hormoonide sekretiini perekonda. See stimuleerib insuliini sekretsiooni, pärsib maohappe sekretsiooni ja mängib otsustavat rolli insuliini sekretsiooni ja glükoosi homöostaasi reguleerimisel.

L- -Karboksüglutamiinhape (Gla) moodustub glutamiinhappe translatsioonijärgsel karboksüülimisel, mille tulemuseks on kaltsiumiioone siduda võimelised valgud, nagu osteokaltsiin. Gla-sisaldavad peptiidid sünteesitakse ideaaljuhul Fmoc tahkefaasilise peptiidi sünteesi (SPPS) abil, kuna Gla võib tugevate hapete juuresolekul läbida dekarboksüülimise, saades glutamiinhappe.

Glükagoonilaadsed peptiidid kuuluvad proglukagooni C-terminaalsest piirkonnast pärinevate peptiidhormoonide glükagooni superperekonda. Neid sünteesivad peamiselt soolestiku L-rakud.

Gonadotropiini vabastav hormoon (LHRH) on dekapeptiidhormoon, mida toodetakse hüpotalamuse neurosekretoorsetes rakkudes ja mis vabaneb pulseerivate pursetena hüpofüüsi portaali vereringesse. Pulseeriv sekretsioon on kriitilise tähtsusega reproduktiivfunktsioonide, seksuaalse arengu ja diferentseerumise jaoks.

Kasvuhormooni vabastav hormoon (GHRH), tuntud ka kui somatoreliin, on hüpotalamuse peptiidhormoon, mis stimuleerib hüpofüüsi kasvuhormooni vabastama ja sünteesima.

Kasvuhormooni vabastav hormoon (GHRH), tuntud ka kui somatoreliin, on hüpotalamuse peptiidhormoon, mis stimuleerib hüpofüüsi kasvuhormooni vabastama ja sünteesima.

Inimese leukotsüütide antigeen (HLA) viitab rakkude pinnal leiduvale valkude rühmale, millel on oluline roll immuunsüsteemi võõrainete äratundmisel. Neid kodeerivad inimestel peamised histocompatibility kompleksi (MHC) geenid ja need on olulised antigeenide esitlemiseks T-rakkudele, võimaldades immuunsüsteemil eristada oma- ja mitteomarakke. HLA molekulid on väga mitmekesised ja polümorfsed, soodustades märkimisväärselt individuaalset immuunvastust ja vastuvõtlikkust autoimmuunhaigustele ja transplantaadi äratõukereaktsioonile.

2-hüdroksü-4-metoksübensüül on happe suhtes labiilne formamiidi kaitserühm, mida kasutatakse peptiidide sünteesis karkassi pöörduvaks muutmiseks. See lisatakse aminohappe või Fmoc-Hmb dipeptiidina (Fmoc-Xaa-HmbYaa-OH) tahkefaasilise Fmoc peptiidi sünteesi (SPPS) käigus, vältides agregatsiooni ja võimaldades tõhusat peptiidi pikendamist. Hmb aitab kaasa ka tsüklistamise reaktsioonidele ja takistab asparagiini moodustumist.

L-homoarginiin on L-arginiini homoloog, lühendatult Har, ja seda võib leida plasmast ja uriinist. Homoarginiin on lüsiini guanidiinimise tulemus, mida saab läbi viia ka peptiididel ja valkudel.

Homotsitrulliin on L-tsitrulliini homoloog, lühendatult Hci, ja seda saab tuvastada inimese uriinis.

L-homotsüsteiin on tsüsteiini homoloog, lühendatult Hcy, ja seda toodetakse metioniini demetüleerimisel. Kõrgenenud vere Hcy tase on südame-veresoonkonna ja neurodegeneratiivsete haiguste riskitegur. Erinevalt Cys derivaatidest ei ratseemiseeru Hcy derivaadid sidestamise ajal ega ka -elimin.

L-leutsiini homoloogid, lühendatult Hle.

Homofenüülalaniin, fenüülalaniini homoloog, lühendatult Hph, on AKE ja reniini inhibiitorite komponent. Fmoc-Homophe-OH on potentsiaalne põletikuvastane ravim.

L-homoproliin või L-pikoolhape, lühendatult Pip või Hpr. Proliini homoloog Hpr on L-lüsiini lagunemissaadus. Mõlemat enantiomeeri saab tuvastada inimese plasmas. Kuna proliinijäägid mõjutavad tugevalt peptiidi konformatsiooni, võib Pro asendamine Hpr-ga (või asetidiin-2-karboksüülhappega (Aze)) muuta selle sekundaarset struktuuri.

L-transhüdroksüproliini toodetakse translatsioonijärgselt proliini oksüdeerimisel. Hyp on kollageeni ja rannakarbi valgu põhikomponent.

Isoseriin, L-seriini isomeer, on -aminohape.

ivDde, amino-kaitserühma, saab deprotekteerida ja lõhustada 2% hüdrasiinhüdraadiga DMF-s. ivDde on stabiilsem kui Dde, et sagedased mitmed piperidiiniravid Fmoc-SPPS-i ajal. Nω-ivDde saab valikuliselt eemaldada Dap-, Dab Orn- või Lys-ist, võimaldades Nω-aminorühma sünteetilist vaigupealset modifitseerimist.

Keyhole limpet hemocyanin (KLH) on suur hapnikku kandev multisubühikuline metalloproteiin, mida leidub hiiglasliku võtmeaugu limpet hemotsüaniini hemolümfis. Antigeeni kandjana suurendab KLH tavaliselt immunogeensust ja antigeeni fikseerimise võimet, sidudes sihtmärkpolüpeptiidjärjestusi, soodustades oluliselt tõhusate, spetsiifiliste ja funktsionaalsete antikehade teket.

Luteiniseeriv hormooni vabastav hormoon (LHRH või GnRH) on dekapeptiidhormoon, mida sünteesivad hüpotalamuse neurosekretoorsed rakud ja mis vabaneb pulseerivalt hüpofüüsi portaali vereringesse. Pulseeriv sekretsioon on kriitilise tähtsusega reproduktiivse funktsiooni, seksuaalse arengu ja diferentseerumise jaoks.

Peptiidide kavandamisel ja sünteesil saavad uurijad sisestada linkeri biotiini või fluorestseeruva aine ja peptiidide vahele. Tavaline hüdrofoobne speisser on aminoheksaanhape (Ahx) ja tavaline hüdrofiilne speisser on polü(etüleenglükool) (PEG).

Külmkuivatusprotsess, mille käigus eemaldatakse kuumustundlikest materjalidest vedelik. Materjal külmutatakse, asetatakse kõrgvaakumi alla ja hoitakse madalal temperatuuril. Vaakumi tekitatud rõhk põhjustab jää muutumise tahkest olekust gaasiliseks ilma vedelat olekut läbimata. Peptiidid tarnitakse tavaliselt lüofiliseeritud pulbrina.

Vedelikkromatograafia-massispektromeetria on mitmekülgne analüütiline meetod, mis ühendab vedelikkromatograafia massispektromeetriaga, et saada üksikasjalikku teavet komplekssete proovide molekulide koostise ja struktuuri kohta.

Mitmed antigeensed peptiidid. Mitme antigeense peptiid on üks tõhus viis kõrge tiitriga peptiidvastaste antikehade ja sünteetiliste peptiidvaktsiinide tootmiseks.

Maatriks-assisteeritud laserdesorptsiooni/ionisatsiooni massispektromeetria (MALDI-MS) on analüütiline meetod, mida kasutatakse ioonide massi ja laengu suhte mõõtmiseks. See on eriti kasulik biomolekulide, nagu peptiidid, valgud ja polümeerid, analüüsimiseks.

Massispektromeetria (MS) on võimas analüütiline tehnika, mida kasutatakse ioonide massi ja laengu suhte (m/z) mõõtmiseks.

4-Metoksü- -naftüülamiid, lühendatult MNA, on fluorofoor, mis on tavaliselt seotud karboksüpeptidaasi substraadiga C-otsas. Lõhustatud 4M NA ergastub lainepikkusel 335-350 nm ja kiirgab lainepikkusel 410-440 nm

Metoksübenseensulfonüül (Mbs) on guanidüüli kaitserühm, mida kasutatakse Boc-põhises tahkefaasilises peptiidisünteesis (Boc-SPPS). Selle kaitserühma saab deprotekteerida vesinikfluoriidiga (HF) lõhustamise teel.

4-Metüülbensüül (Mbzl) on sulfhüdrüüli kaitserühm, mida kasutatakse Boc-põhises tahkefaasilises peptiidisünteesis (Boc-SPPS). Mbzl on stabiilsem kui metoksübensüül (Mob) sagedase trifluoroäädikhappe (TFA) töötlemisel ja seda saab eemaldada vesinikfluoriidi (HF) lõhustamise teel.

(7-Metoksükumariin-4-üül)äädikhape (Mca) on fluorofoor, mida saab siduda aminorühmaga.
Mca seondub dinitrofenüüliga (Dnp) fluorestsentsresonantsenergia ülekande (FRET) substraatide jaoks. Ergastuslainepikkus on 325 nm ja emissiooni lainepikkus 392 nm.

Melaniini kontsentreeriv hormoon (MCH) on tsükliline neuropeptiid, mis eraldati esmakordselt kaladest ja rottidest. MCH tegeleb peamiselt kalade naha pigmentatsiooni ja imetajate toitumiskäitumise reguleerimisega.

Metüül, lihtsaim alküülasendaja, osaleb N-, O- ja S-metüülimises, mis moodustavad peptiidi püsivad modifikatsioonid.

3-Metoksüsuktsinüül, mis vastab deamineeritud Asp(OMe)-le, on polaarne N-otsa blokeeriv rühm, mida tavaliselt lisatakse karboksüpeptidaasi substraatidesse.

Metüleerimine on peptiidide ja valkude translatsioonijärgne modifikatsioon (PTM), kus metüülrühm (-CH3) lisatakse ensümaatiliselt spetsiifilistele aminohappejääkidele, tavaliselt lüsiinile (Lys), arginiinile (Arg), histidiinile (His) või glutamaadile ( Glu). See modifikatsioon võib oluliselt mõjutada valgu funktsiooni, stabiilsust ja interaktsioone teiste molekulidega, mängides seega keskset rolli mitmesuguste rakuprotsesside, sealhulgas geeniekspressiooni, signaaliülekande ja valgu-valgu interaktsioonide reguleerimisel.

Peamine histocompatibility kompleks (MHC) on geneetiline piirkond, mis sisaldab MHC molekule kodeerivaid geene. Need molekulid mängivad immuunsüsteemis ja autoimmuunsuses üliolulist rolli. Inimestel tuntakse seda kompleksi ka inimese leukotsüütide antigeeni (HLA) süsteemina.

MHC I klassi (MHC I) molekulid on raku pinnal olevad valgud, mis esitlevad peptiide raku seest tsütotoksilistele T-rakkudele. See aitab immuunrakkudel ära tunda ja hävitada nakatunud või ebanormaalseid rakke, mis on üliolulised immuunkaitseks patogeenide ja vähi vastu.

MHC II klassi (MHC II) molekulid on rakupinna valgud, mis esitlevad võõrainetest saadud peptiide abistaja-T-rakkudele. See interaktsioon on oluline immuunvastuste koordineerimiseks ja teiste immuunrakkude aktiveerimiseks patogeenide vastu.

Monometüülitud arginiin (MMA) on translatsioonijärgne modifikatsioon, kus peptiidi või valgu arginiinijäägi guanidinolämmastikule lisatakse ensümaatiliselt üks metüülrühm (-CH3).

3-merkaptopropüülamiin, mida saab kasutada peptiidligandina või modifikaatorina erinevates biokeemilistes ja biomeditsiinilistes rakendustes.

Müristoüülimine on lipiidide modifitseerimise protsess, mille käigus müristoüülrühm, mis koosneb 14-süsinikküllastunud rasvhappest, on kovalentselt seotud peptiidi N-otsaga. See modifikatsioon kinnitab valgu rakumembraanile, hõlbustades selle lokaliseerimist ja osalemist erinevates rakuprotsessides.

-(1-naftüül)-L-alaniin on mittepolaarne aminohappe derivaat, mis sarnaneb fenüülalaniiniga, kuid sisaldab fenüülrühma asemel naftüülrühma.

-(2-Naftüül)alaniin on mittepolaarne aminohappe derivaat, mis sarnaneb fenüülalaniiniga, kuid sisaldab fenüülrühma asemel naftüülrühma.

3-nitrobens-2-oksa-1, 3-diasool (NBD) sisestatakse tavaliselt reaktiivi NBD-Cl konjugeerimisel peptiidiga. NBD-märgistatud peptiide valitakse laialdaselt nende kasulikkuse tõttu uuringutes, mis keskenduvad membraanidele ja rakubioloogiale.

N-etüülamiidi võib pidada C-terminaalse alaniini dekarboksüülitud vormiks. LHRH agonisti busereliinis toimib NHEt C-terminaalse glütsiinamiidi analoogina. Peptiid N-etüülamiid on resistentne karboksüpeptidaaside poolt põhjustatud lagunemise suhtes.

L-norleutsiin (Nle) on L-metioniini stabiilne isosteer. Kui peptiidi bioloogiline aktiivsus on sulfoksiidi moodustumise tõttu kahjustatud, võib Met asendada Nle-ga, ilma et see tavaliselt muudaks selle funktsionaalset käitumist.

NOTA, 1,4,7-triasatsüklononaan-1,4,7-triäädikhape on bifunktsionaalne kelaat, mis toimib raamistikuna PET-pilditööriistade koostamisel. Seda kasutatakse ka sondi projekteerimisel ja signaali võimendamisel mitmevalentsete efektide kaudu ning sellel on potentsiaalsed rakendused diagnostilise galliumi radiofarmatseutilise ravimina.

N-Me viitab tavaliselt N-metüülimisele, keemilisele modifikatsioonile, milles metüülrühm (-CH3) on seotud molekulis lämmastikuaatomiga, näiteks N-Me-Gly, N-Me-Ser, N-Me -Tyr, N-Me-Thr, N-Me-Asp, N-Me-Glu, N-Me-Ala, N-Me-Phe, N-Me-Leu, N-Me-Ile, N-Me -Val, N-Me-Met, N-Me-Nle, N-Me-Nva jne.

NODAGA,1,4,7-triasatsüklononaan,1-glutaarhape-4,7-diaäädikhape on suurepärane bifunktsionaalne kelaatija metallorgaaniliste radiofarmatseutiliste preparaatide kujundamiseks ja arendamiseks, pakkudes märkimisväärset kasutusvõimalused diagnostilises pildistamises ja sihipärases kiiritusravis.

2-Nitrofenüültio (Nps) on S-kaitserühm, mida kasutatakse Boc-põhises tahkefaasilises peptiidisünteesis (Boc-SPPS). Tioolid võivad seda lõhustada, täpsemalt tsüsteiini vaba sulfhüdrüülrühma (Cys) kaudu, mis viib samaaegse disulfiidsideme moodustumiseni.

Neuropeptiid Y (NPY) on ajus silmapaistev neuropeptiid ja osa neuropeptiidide Y perekonnast, kuhu kuuluvad pankrease polüpeptiid (PP) ja peptiid YY (PYY).

2-Nitro-2-püridüülsulfenüül (Npys) on S-kaitserühm, mis ühildub Boc-põhise tahkefaasilise peptiidi sünteesiga (Boc-SPPS). Npy-sid võivad lõhustada tioolid, täpsemalt tsüsteiini vaba sulfhüdrüülrühma (Cys) kaudu, mille tulemusena moodustub samaaegne disulfiidside.

Norvaliin on mittepolaarne alifaatne aminohape ja -aminovõihappe (Abu) homoloog.

-Naftüülamiid on fluorofoor, mida tavaliselt kasutatakse karboksüpeptidaasi substraatides ja mis on tavaliselt seotud peptiidide C-otsaga. Lõhustatud NA ergastab 330 nm juures ja kiirgab 370 nm juures.

-Naftüülamiid on fluorofoor, mida tavaliselt kasutatakse karboksüpeptidaasi substraatides ja mis on tavaliselt seotud peptiidide C-otsaga. Lõhustatud NA juures 320-340 nm, emissioon juures 410-420 nm.

Allüülester on karboksüüli kaitserühm, mis ühildub nii Fmoc- kui ka Boc-põhise tahkefaasilise peptiidi sünteesiga (SPPS). Sarnaselt Alociga saab allüülestreid selektiivselt eemaldada töötlemisel Pd(PPh3)4-ga. Fmoc-SPPS-is on Asp (OAll) vastuvõtlik aluse katalüüsitud aspartimiidi moodustumisele.

Bensüülestrit, karboksüüli kaitserühma, saab eemaldada katalüütilise hüdrogeenimise (nt H2/Pd) või tugevate hapetega.

OcHex on standardne karboksüülrühma kaitserühm, mida kasutatakse Boc-põhises tahkefaasilises peptiidisünteesis (Boc-SPPS).

4-(N-[1(4,4-dimetüül-2, 6-dioksotsükloheksülideen)-3-etüülbutüül]amino)bensüülester (ODmab) on karboksüülrühma kaitsev aine rühm, mida kasutatakse Fmoc-põhises tahkefaasilises peptiidide sünteesis (Fmoc-SPPS). Seda saab lõhustada ja deprotekteerida, kasutades 2% hüdrasiinhüdraati DMF-s.

2,4-Dimetoksübensüülester on happe suhtes väga labiilne karboksüülkaitserühm, mida saab eemaldada 1% TFA-ga diklorometaanis.

Etüülester Etüülestrite eemaldamiseks vajalike rangete tingimuste tõttu võib peptiidide modifitseerimine etüülestritega suurendada nende lipofiilsust ja stabiilsust.

9-Fluorenüülmetüülester on aluse suhtes labiilne karboksüülkaitserühm, mida saab eemaldada piperidiiniga DMF-s.

Heksüülestrid Etüülestrite eemaldamiseks vajalike rangete tingimuste tõttu võib peptiidide modifitseerimine etüülestritega suurendada nende lipofiilsust ja stabiilsust.

L-otahüdroindool-2-karboksüülhape (Oic) on mittepolaarne, takistatud aminohape. Selle proliiniga seotud aminohappe sisestamine polüpeptiidi järjestusse mõjutab tugevalt peptiidi konformatsiooni.

Metüülestrid on vedelfaasilises sünteesis poolpüsivad C-otsa kaitserühmad ja neid saab muundada peptiidhüdrasiidideks, reaktiivsete peptiidasiidide prekursoriteks. Asiidsidestamine on vedelfaasi peptiidide sünteesis endiselt kõige populaarsem fragmentide sidumise meetod.

3-Metüülpent-3-üülester (OMpe) on happelabiilne karboksüüli kaitserühm, mida kasutatakse sageli asparagiinhappe (Asp) karboksüülrühma kaitsmiseks Fmoc-põhises tahkefaasilises peptiidisünteesis (Fmoc-SPPS). ).See steeriliselt nõudlikum tert-butüülestri analoog töötati välja spetsiaalselt aluse katalüüsitud asparagimiidi moodustumise vähendamiseks.

Boc- või Z-aminohapete orto-nitrofenüülestrid on eelaktiveeritud derivaadid, mida kasutatakse peptiidilahuse sünteesis.

Ornitiini (Orn) toodetakse arginiinist uurea tsükli ajal ja seda võib täheldada ka peptiidides kui arginiini lagunemissaadust. Orni moodustumine arginiini guanidiiniosa atsüülimise teel on peptiidide sünteesis tavaline kõrvalreaktsioon.

Hüdroksüsuktsiinimiidi ester (OSu, lühendatult NHS) on eelaktiveeritud aminohappe derivaat, mida kasutatakse tavaliselt peptiidide sünteesil, eriti peptiidide modifitseerimisel. OSu estrid on ohutud, mittesteerilised, ühilduvad vesisüsteemidega ja kergesti käsitsetavad.

Tert-butüülester, happelabiilne karboksüülkaitserühm aminohapete jaoks peptiidide sünteesis.

4-aminobensoehape (para-aminobensoehape), saab kasutada antikeha-ravimi konjugaadi linkerite sünteesiks. Näiteks Mal-PEG2-Val-Cit-PABA on lõhustav antikehade konjugaadi (ADC) linker.

PABC (para-aminobensüülkarbamaat) on keemiline ühend, mida kasutatakse antikeha-ravimi konjugaatide (ADC) sünteesil linkerina. See hõlbustab ravimite kontrollitud sidumist antikehadega, võimaldades sihipärast ravimite kohaletoimetamist vähiravis ja muudes biomeditsiinilistes rakendustes. Näiteks Mc-Val-Cit-PABC-PNP on katepsiiniga lõhustav linker, mida kasutatakse antikeha-ravimi konjugaatides (ADC).

Hüpofüüsi adenülaattsüklaasi aktiveeriv polüpeptiid (PACAP) on väga konserveerunud neuropeptiid, mida ekspresseeritakse silmatorkavalt kogu imetaja ajus. See avaldab oma bioloogilist mõju, suurendades rakusisest tsüklilist AMP taset retseptori interaktsiooni kaudu.

Palmitoüül, N-otsa või küljele sisestatud mittepolaarne atsüülrühm. Palmitoüülimist on täheldatud ka kui valkude translatsioonijärgset modifikatsiooni.

Fenüülatseetamiidmetüülvaik on vaik, mis on loodud spetsiaalselt Boc-põhiseks tahkefaasiliseks peptiidide sünteesiks (Boc-SPPS). Sellel vaigul sünteesitud peptiide saab vabastada HF lõhustamise abil.

Antikeha-ravimi konjugaatides (ADC) ühendab linker antikeha tsütotoksilise kasuliku koormusega. Kasuliku koormuse valik on kriitiline, kuna see määrab ADC-de tõhususe ja spetsiifilisuse spetsiifiliste vabastamismehhanismide kaudu sihtkudedesse ravi viimisel.

2,2,4,6,7-pentametüüldihüdrobensofuraan-5-sulfonüül (Pbf) on eelistatud guanidino kaitserühm, mida kasutatakse Fmoc-põhises tahkefaasilises peptiidisünteesis (Fmoc-SPPS). Sellel on Pmc-ga võrreldes pisut suurem happelabiilsus.

Penitsillamiin on L-tsüsteiini analoog, mida iseloomustab metüülrühma (-CH3) asendamine karboksüülhappega (-COOH).

Peptiidide iseseisev kokkupanek on siis, kui peptiidid korraldavad end loomulikult ilma välise sekkumiseta järjestatud struktuurideks. seda protsessi juhivad mittekovalentsed interaktsioonid, nagu vesinikside, hüdrofoobsed vastasmõjud, elektrostaatilised jõud ja π-π virnastamine. Peptiidide iseseisev kokkupanek võib viia erinevate nanostruktuuride, sealhulgas kiudude, sfääride, lehtede ja geelide moodustumiseni, mida saab kasutada materjaliteaduses, biotehnoloogias ja meditsiinis.

Fenüülatsetüül (Phenylac või Phac) on atsüülrühm, mis on tavaliselt seotud peptiidide N-otsaga ja mida iseloomustab atsetüülrühmaga (Ac) võrreldes madalam polaarsus. See kujutab endast peptiidide püsivat modifikatsiooni.

fenüülglütsiin (Phg) on ​​aminohappe derivaat, milles vesinikuaatomit glütsiini molekulis asendab fenüülrühm

Peptiid Histidiin Isoleutsiin (PHI), VIP ja sekretiiniga seotud seapeptiid.

Peptiid histidiinmetioniin (PHM), inimese peptiid, mis on seotud VIP-iga.

Isoelektriline punkt (pI) on defineeritud kui pH tase, mille juures valgu/peptiidi netolaeng on null (Smoluch et al., 2016).

2,2,5,7,8-Pentametüülkromaan-6-sulfonüül (Pmc) on guanidinüüli kaitserühm, mida tavaliselt kasutatakse Fmoc-põhises tahkefaasilises peptiidisünteesis (Fmoc-SPPS). See on Pbf-ga võrreldes pisut vähem happelabiilne.

p-nitroaniliin, kromofoor, on tavaliselt konjugeeritud karboksüpeptidaasi substraatide C-otsaga. Vabanenud p-nitroaniliini neeldumist mõõdetakse tavaliselt lainepikkustel umbes 405 või 410 nm.

L-propargülglütsiini (Pra) toodavad mikroorganismid. Seda aminohapet, mida iseloomustab selle kolmiksideme struktuur, peetakse kõrgelt aluseks peptiidide sünteesimisel, mis on võimelised osalema "klõpsukeemia" reaktsioonides, pälvides selles valdkonnas märkimisväärset tähelepanu.

Paratüroidhormoon (PTH) on kõrvalkilpnäärmete poolt vabanev peptiidhormoon, mis on ülioluline kaltsiumi ja fosfori homöostaasi säilitamiseks ekstratsellulaarses vedelikus.

Valkude translatsioonijärgsed modifikatsioonid (PTM) lisavad funktsionaalseid rühmi või valke, lõikavad reguleerivaid subühikuid või lõhustavad terveid valke. Need muutused, nagu fosforüülimine, glükosüülimine, metüülimine, atsetüülimine, lipidatsioon, ubikvitineerimine, nitrosüülimine ja proteolüüs, mõjutavad rakkude normaalset tööd ja haiguse ajal. PTM-ide mõistmine on alusuuringute ja uute ravimeetodite leidmise jaoks ülioluline.

püroglutamiinhape, mida tuntakse ka lühenditena nagu Pgl, Glp, pGlu või

fenüülasobensüülmetoksükarbonüül on kromofoorne N-kaitserühm, mida kasutatakse peptiidide sünteesis ja mida saab lõhustada katalüütilise hüdrogeenimise või tugeva happega. Sellel on maksimaalsed neeldumislainepikkused lainepikkustel 229 nm, 320 nm ja 441 nm.

Kustutajapaar koosneb fluorestsentsmolekulist (fluorofoor) ja kustutajamolekulist, mida kasutatakse fluorestsentsipõhistes uuringutes ja analüüsides. Kustutaja neelab fluorofoori kiirgava valguse, vähendades selle fluorestsentsi. Kui fluorofoor ja kustutaja eraldatakse, näiteks biokeemilise reaktsiooni kaudu, suureneb fluorestsentsi signaal. See võimaldab teadlastel mõõta reaalajas muutusi ja koostoimeid. Seda tehnikat kasutatakse tavaliselt sellistes rakendustes nagu reaalajas PCR, molekulaarsondid ja FRET (Försteri resonantsenergia ülekande) testid.

Fluor-18 on radioligand, mida tavaliselt kasutatakse PET-pildis, et hinnata glükoosi metabolismi kudedes, ning seda kasutatakse sageli vähidiagnostikas ja ajukuvamises.

Juhuslik peptiidide raamatukogu on paljude lühikeste peptiidijärjestuste kogum, mis on loodud juhuslikult. Igal raamatukogu peptiidil on konkreetne arv juhuslikult määratud järjestustega aminohappeid, luues mitmekesise valiku peptiidimolekule. Teadlased kasutavad neid raamatukogusid spetsiifiliste omaduste, bioloogilise aktiivsuse või sihtmolekulidega interaktsiooniga peptiidide skriinimiseks. Need on eriti kasulikud ravimite avastamisel, immunoloogial ja valgu-valgu interaktsioonide uurimisel, aidates tuvastada uusi ravimeid ja mõista keerulisi bioloogilisi protsesse.

Jääk on individuaalne aminohape peptiidis või valgus. Kuna aminohapped ühinevad peptiidsidemete kaudu nende ahelate moodustamiseks, nimetatakse iga aminohappeühikut jäägiks. Seda terminit kasutatakse seetõttu, et peptiidsideme moodustumisel kaotab iga aminohape veemolekuli (H2O), jättes maha jäägi.

Vaik on lahustumatu polümeer, mida kasutatakse tahkefaasilises peptiidisünteesis (SPPS) tahke toena aminohapete pideval lisamisel. Vaiguhelmed tagavad stabiilse ja inertse pinna, millele algsed aminohapped on kovalentselt kinnitatud, võimaldades ehitada peptiidahelat jääkhaaval.

Rodamiin B on erkroosa kuni punane värv, mille ergastuslainepikkus on tavaliselt umbes 540-570 nm ja kiiratava valguse ulatus on 560-580 nm. Tavaliselt konjugeeritakse see peptiidjärjestusega peptiidi N-terminaalse aminorühma kaudu

Pöördfaasiline kõrgjõudlusega vedelikkromatograaf.

Struktuuri-aktiivsuse suhte (SAR) ravimid töötatakse välja, uurides seost ravimi keemilise struktuuri ja selle bioloogilise aktiivsuse vahel.

Sarkosiin, lihtsaim N-alküülitud aminohape.

Sümmeetrilist dimetüülarginiini (SDMA, Arg(Me)2), Fmoc-Arg(Me)2-OH (sümmeetrilist) saab otse kasutada sümmeetrilist dimetüülarginiini sisaldavate peptiidide sünteesiks.

Tahkefaasiline peptiidide süntees (SPPS) on peptiidide keemilise sünteesi meetod, kus peptiidid pannakse järk-järgult kokku tahkele alusele või vaigule, lisades järjestikku kaitstud aminohappeid. SPPS hõlmab kahte strateegiat: Fmoc-SPPS ja Boc-SPPS, mis erinevad N-aminorühma kaitserühmade (Fmoc või Boc) ja külgahela kaitserühmade valiku poolest. Valitud N-amino-kaitserühma tüüp määrab külgahela kaitsestrateegia ja tingimused peptiidi lõplikuks lõhustamiseks vaigust.

Statiin, lühendatult Sta, on mittevalguline aminohape, mida kasutatakse sageli peptiidmimeetikumide kujundamisel, eriti proteaasi inhibiitorite sünteesil.

Tert-butüültio (StBu) on S-kaitserühm, mis lõhustatakse fosfiini redutseerimisel ja mis ühildub Boc-SPPS-iga.

Suktsinüül on polaarne N-terminaalne modifikatsioon, mis vastab deamineeritud aspartaadile ja on tavaliselt kaasatud karboksüpeptidaasi substraatidele.

TAMRA, lühendatult ka TMR, on fluorofoor, mida saab siduda aminorühmaga. Seda kasutatakse sageli koos FAM-iga FRET-substraatide jaoks. TAMRA ergastuslainepikkus on 485 nm ja emissioonilainepikkus 535 nm.

Tert-butüül on happelabiilne kaitserühm, mida tavaliselt kasutatakse alkoholide ja fenoolide jaoks ja mida saab lõhustada trifluoroäädikhappe (TFA) abil.

Trietüülammooniumfosfaat on puhver, mida kasutatakse pöördfaasi HPLC liikuvates faasides.

Trifluoroäädikhapet (TFA) kasutati peptiidide lõhustamiseks vaigust Fmoc-SPPS-is ja tBu-st pärinevate kaitserühmade eemaldamiseks.

Trifluorometaansulfoonhape (TFMSA) on tugevam hape kui TFA. TFMSA-d saab kasutada Boc-SPPS strateegia viimases lõhustamisetapis väga toksilise HF-i ohutuma alternatiivina.

L-tert-leutsiin (Tle) on steeriliselt nõudlike kõrvalahelatega mittepolaarne aminohape, mis destabiliseerib -heeliseid.

2,4,6-Trimetoksübensüül on happelabiilne Asn- ja Gln-amiidi kaitserühm, mida kasutatakse Fmoc-SPPS-is.

Tosüüli kasutatakse Boc-SPPS-is guanidiini ja imidasooli kaitserühmana ning seda saab eemaldada Na/NH3 abil.

Tritüül (Trt) on happelabiilne kaitserühm, mida kasutatakse Asn, Cys, Gln ja His jääkide jaoks Fmoc-SPPS-is. Seda saab selektiivselt eemaldada trifluoroäädikhappe (TFA) abil.

Puhtad peptiidid eksisteerivad tavaliselt pärast külmkuivatamist valge pulbri kujul.

Vasoaktiivne soolepeptiid (VIP) on 28-aminohappepeptiid, mis kuulub glükagooni-greliini-sekretiini peptiidide superperekonda.

9-Ksanthüdrüül (Xan) on happelabiilne amiidkaitserühm, mida kasutatakse Boc-SPPS-is Asn- ja Gln-jääkide jaoks. Xani saab selektiivselt eemaldada TFA abil.

Kui peptiid on märgistatud FAM fluorestseiiniga, on lüofiliseeritud pulber tavaliselt kollane.

Z-bensüüloksükarbonüülrühma, lühendatult Z või Cbz, kasutatakse peptiidide sünteesis aminokaitserühmana. Seda saab eemaldada hüdrogenolüüsi või tugevate hapete abil puhta HF või HBr/äädikhappena.